Türkiye’de yetiştirilen siyah alacaların kontrol günü süt verimlerine ait genetik parametre tahmininde şansa bağlı regresyon modelinin kullanımı

Son yıllarda, çiftlik hayvanlarıyla ilgili tekrarlanan gözlemlerin yer aldığı veya doğrudan kontrol günü verimlerinin kullanıldığı çalışmalarda, şansa bağlı regresyon modelleri standart hale gelmeye başlamıştır. Bu çalışmada materyal olarak, 1995-2006 yılları arasında Türkiye’de yetiştirilmekte olan 54.845 Siyah Alaca ineğe ait 352.159 adet ilk laktasyon kontrol günü süt verim kaydı kullanılmıştır. Laktasyon içinde aylara göre kontrol günü süt verim ortalamalarının 16.57 kg ile 22.74 kg arasında değiştiği saptanmıştır. Aynı işletmede aynı tarihte elde edilmiş süt verim kayıtları, birer alt grup olarak kabul edilmiştir. Genetik parametre ve damızlık değerlerinin tahmininde şansa bağlı regresyon modelinin kullanıldığı çalışmada, kontrol günü süt verimine ait kalıtım dereceleri 0.12 ile 0.15 arasında tahmin edilmiştir. Bunun yanında, kontrol günü süt verimine ait eklemeli genetik varyans tahminleri $2.33.ile4.49kg^{2}$ arasında, fenotipik varyans tahminleri ise $19.57 ile29.78kg^{2}$arasında değişmiştir.

Anahtar Kelimeler:

Alacalı Sığır, Türkiye, damızlık değeri, sığır, inek, süt sığırı, süt ineği, genetik parametreler, kalıtsallık, laktasyon, süt üretimi, süt verimi, fenotip, regresyon

Application of a random regression model to estimation of genetic parameters of test day milk yields of Turkish holstein firesians

Over the last decade, analyses fitting the so-called random regression model have become a standard procedure for the analyses of data from livestock recording schemes, where the traits of interest are recorded repeatedly and the test day yields are considered directly. 352.159 first lactation test day milk yield records of 54.845 Holstein Friesian cows that raised in Turkey between 1995-2006 were used as material. Means of test day milk yields by month of lactation were found to vary between 16.57 kg and 22.74 kg. Genetic parameters and breeding values were estimated using a random regression model. Records were measured on the same date in a herd were regarded as a sub-group. Estimates of heritability for test day milk yields were between 0.12 and 0.15. In addition, estimates of additive genetic and phenotypic variances ranged from $2.33.to4.49kg^{2}$ and from $19.57 to29.78kg^{2}$ respectively.

Keywords:

Holstein-Friesian, Turkey, breeding value, cattle, cows, dairy cattle, dairy cows, genetic parameters, heritability, lactation, milk production, milk yield, phenotypes, regression,

PDF

___

1. Gurevitch J, Chester Jr ST: Analysis of repeated measures experiments. Ecology, 67 (1): 251-255, 1986.
2. Kirkpatrick M, Lofsvold D, Bulmer M: Analysis of inheritance, selection and evolution of growth trajectories. Genetics, 124 (4): 979-993, 1990.
3. Van Der Werf J: Random Regression in Animal Breeding. Course notes. Jaboticabal, SP Brazil, 2001.
4. Meyer K: Random Regression models for analyses of longitudinal data in animal breeding. Proceedings 54th Session of the International Statistical Institute, Berlin, Germany, 2003.
5. Ulutaş Z, Akman N, Akbulut Ö: Siyah-Alaca ırkı sığırların 305 günlük süt verimi ve buzağılama aralığına ait genetik ve çevre varyansları tahmini. Turk J Vet Anim Sci, 28 (1): 101-105, 2004.
6. Swalve HH: The effect of test day models on the estimation of genetic parameters and breeding values for dairy yield traits. J Dairy Sci, 78 (4): 929-938, 1995.
7. Anonim: International Agreement of Recording Practices, Section 9: ICAR Standard Methods of Genetic Evaluation, 2005. (http://www.icar.org/ recording_guidelines.htm, Accessed: 23.11.2005.
8. Jamrozik J, Schaeffer LR: Estimates of genetic parameters for a test day model with random regressions for yield traits of first lactation Holsteins. J Dairy Sci, 80 (4): 762-770, 1997.
9. Swalve HH: Theoretical basis and computational methods for different test-day evaluation methods. J Dairy Sci, 83 (5): 1115-1124, 2000.
10. Emmerling R, Lidauer M, Mäntysaari EA: Multiple lactation random regression test-day model for Simmental and Brown Swiss in Germany and Austria. Proceedings of the 2002 Interbull Meeting, May 26-27, Interlaken, Switzerland, pp. 111-117, 2002.
11. Strabel T, Szyda J, Ptak E, Jamrozik J: Comparison of random regression test-day models for production traits of dairy cattle in Poland. Proceedings of the 2003 Interbull Meeting, August 28-30, Rome, Italy, pp. 197-201, 2003.
12. Strabel T, Ptak E, Szyda J, Jamrozik J: Multiple-lactation random regression test-day model for Polish Black and White cattle. Proceedings of the 2004 Interbull Meeting, May 29-31, Sousse, Tunisia, pp. 133-136, 2004.
13. Takma Ç: Siyah Alaca Sığırlarda süt veriminin genetik parametre tahmininde kullanılan istatistik yaklaşımların karşılaştırmalı analizi. Doktora Tezi, Ege Üniv. Fen Bil. Enst., 2005.
14. Takma Ç, Akbaş Y: Estimates of genetic parameters for test day milk yields of a Holstein Friesian herd in Turkey with random regression models. Arch Tierzucht, 50 (4): 327-336, 2007.
15. Takma Ç, Akbaş Y: Comparison of fitting performance of random regression models to test day milk yields in Holstein Friesians. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 15 (2): 261-266, 2009.
16. Kumlu S, Akman A: Türkiye damızlık Siyah Alaca sürülerinde süt ve döl verimi. Lalahan Hayv Arş Enst Derg, 39 (1): 1-16, 1999.
17. Meyer K: DFREML 3.0 b Program Package and User Notes. Animal Genetics and Breeding Unit, Univ. New England, Armidale, New South Wales, Australia, 1998.
18. Pool MH, Janss LLG, Meuwissen THE: Genetic parameters of Legendre poly-nomials for first parity lactation curves. J Dairy Sci, 83 (11): 2640-2649, 2000.
19. Jamrozik J, Schaeffer LR: Bayesian comparison of random regression models for test-day yields in dairy cattle. 7th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production (No. 01-03), August 19-23, Montpellier, France, 2002.
20. Kumlu S: Hayvan Islahı. 2. Baskı. Türkiye Damızlık Sığır Yetiştiricileri Merkez Birliği Yayınları, Ankara, 2003.
21. Jamrozik J, Schaeffer LR, Liu Z, Jansen G: Multiple trait random regression test day model for production traits. Proceedings of the 1997 Interbull Meeting, August 28-29, Vienna, Austria, pp. 43-47, 1997.
22. De Roos APW, Harbers AGF, De Jong G: Random herd curves in a test-day model for milk, fat, and protein production of dairy cattle in the Netherlands. J Dairy Sci, 87 (8): 2693-2701, 2004.
23. Strabel T, Jamrozik J: Genetic analysis of milk production traits of Polish black and white cattle using large-scale random regression test-day models. J Dairy Sci, 89 (8): 3152-3163, 2006.
24. Strabel T, Misztal I: Genetic parameters for first and second lactation milk yields of Polish black and white cattle with random regression test-day models. J Dairy Sci, 82 (12): 2805-2810, 1999.
25. De Roos APW, Harbers AGF, De Jong G: Genetic parameters of test-day somatic cell score estimated with a random regression model. Proceedings of the 2003 Interbull Meeting, August 28-30, Rome, Italy, pp. 97-101, 2003.
26. Muir BL, Kistemaker G, Jamrozik J, Canavesi F: Genetic parameters for a multiple-trait multiple-lactation random regression test-day model in Italian Holsteins. J Dairy Sci, 90 (3): 1564-1574, 2007.
27. Takma Ç, Akbaş Y: Variance components and genetic parameter estimates using random regression models on test day milk yields of Holstein Friesians. Kafkas Univ Vet Fak Derg, 15 (4): 547-551, 2009.
28. Kumlu S: Türkiye damızlık Siyah Alaca sürülerinin süt verimlerinde genetik ve fenotipik yönelimler. Akdeniz Üniv Zir Fak Derg, 12 (1): 11-24, 1999.
29. Akman N, Kumlu S: Türkiye damızlık Siyah Alaca sığırlarında süt verimi bakımından gerçekleşen ve beklenen genetik ilerlemenin tahmini. III. Ulusal Zootekni Bilim Kongresi Bildiriler Kitabı, s. 65-75, 14-16 Ekim, Ankara, 2003.